Jenis penyakit yang sering melanda pada tanaman cengkeh seperti : 1. Busuk akar - Penyebabnya adalah cendawan, penyakit ini terjadi di persemaian, dan sewaktu-waktu dapat pula timbul sebelum tanaman mencapai umur tiga tahun. Gejala yang tampak yaitu daun terlihat kekuning-kuningan, kemudian layu dan akhirnya mengering. Bila di cabut maka akar tanaman cengkeh tersebut kelihatan busuk. + pemberantasanya yaitu dengan cara di cabut lalu memusnahkanya dengan cara membakarnya. Dapat juga mengunakan obat cope roxy chloride, yang tiap 5 gram kita campur dengan air sebanyak satu liter, cara ini kita gunakan bila tanaman cengkeh belum mati. 2. Penyakit Daun Penyebabnya lagi-lagi cendawan juga. - gejala yang timbul Pada daun tua terdapat bintik-bintik kuning kecoklat-coklatan. Bagian yang diserang adalah bagian batang, baik di bawah maupun di puncak pohon bagian batang. + pemberantasan yaitu dengan cara mengurangi peneduh serta menyemprotkan obat cope roxy chloride. 3 Mati Ranting Penyebabnya adalah pengambilan zat-zat hara tergangu, hal ini terjadi karena tanaman dekat dengan genangan air. Penyakit ini menyerang tanaman cengkeh yang baru menghasilkan buah yakni setelah umur lima tahun. - gejalanya pada cabang tanaman daunnya berubah menjadi kuning, lalu layu, dan berguguran. + pencegahanya yaitu dengan cara memperbaiki aliran air pada tanah tempat tumbuhnya tanaman cengkeh, tanah di gemburkan dan dipupuk secara baik. 4 Mati Kering Tanaman cengkeh yang masih muda tidak tahan terhadap musim kemarau yang agak lama, karena itu untuk pencegahanya dengan cara memberi peneduh dan menyiramnya secara rutin. 5 Gangang Penyebabnya adalah semacam gangang, yang diserang adalah seluruh daun, baik di persemaian maupun di kebun tanaman cengkeh. - Gejalanya yaitu pada daun terdapat bercak-bercak kecil yang berwarna merah di tengahnya serta bintik-bintik kuning. + pencegahanya yaitu dengan cara menambah peneduh dan pemeliharaan yang tepat.