Penggunaan pupuk kimia dalam budidaya tanaman bukan tanpa efek samping. Residu yang terakumulasi pada tanah tidak hanya menyebabkan pengerasan/perubahan pada struktur tanah, tetapi juga mencemari lingkungan sehingga memberikan dampak yang kurang baik pada mikroorganisme tanah. Untuk menghindari masalah ini, banyak metode yang sudah dikaji sebagi solusi dalam pemenuhan hara atau nutrisi bagi tanaman guna memperoleh produktivitas tanaman tinggi tanpa menimbulkan efek jangka panjang. Seperti penggunaan pupuk organik dan pupuk hayati. Yang juga menjadi perhatian saat ini adalah pemanfaatan Plant growth-promoting Rhizobacteria (PGPR) / Rhizobakteri Pemacu Pertumbuhan Tanaman PGPR merupakan mikroorganisme yang dapat memacu pertumbuhan tanaman dengan cara yang ramah lingkungan. Bakteri yang terdapat dalam PGPR adalah sejenis bakteri yang biasa hidup di akar tanaman. Genera/golongan bakteri yang dapat dimanfaatkan sebagai PGPR antara lain: Agrobacterium, Arthrobacter, Azotobacter, Azospirillum, Bacillus, Burkholderia, Caulobacter, Chromobacterium, Erwinia, Flavobacterium, Micrococcous, Pseudomonas, Serratia, keluarga Rhizobiaceae termasuk Allorhizobium, Bradyrhizobium, Mesorhizobium dan Rhizobium, endophytes dan spesies Frankia. Mikroorganisme ini hidup berkoloni di sekitar akar tanaman yang dapat membantu memacu pertumbuhan tanaman dan meningkatkan ketahanan tanaman terhadap jamur patogen. Bakteri PGPR meningkatkan pertumbuhan tanaman secara langsung dengan baik karena kemampuannya mengikat nitrogen bebas dari alam atau istilahnya fikasi nitrogen bebas. Nitrogen bebas diubah menjadi amonia kemudian disalurkan ke tanaman. Tidak hanya nitrogen, PGPR juga memberikan pasokan mineral penting lainnya seperti fosfor dan kalium bagi tanaman. Secara tidak langsung, PGPR mengurangi efek penghambatan dari berbagai patogen pada pertumbuhan dan perkembangan tanaman dalam bentuk agen biokontrol, bersimbiosis dengan akar, dan pelindung lingkungan. PGPR memiliki mekanisme langsung yang memfasilitasi penyerapan nutrisi atau meningkatkan ketersediaan nutrisi melalui: Fiksasi Nitrogen. PGPR memiliki kemampuan untuk memperbaiki nitrogen atmosfer dan menyediakannya bagi tanaman melalui dua mekanisme: simbiotik dan non-simbiotik. Solubilisasi fosfat. Mekanisme pelarutan fosfat utama yang digunakan oleh PGPR meliputi: (a) pelepasan senyawa pelarutan atau pelarutan mineral, misalnya. anion asam organik, proton, ion hidroksil, CO2; (b) pembebasan enzim ekstraseluler (mineralisasi fosfat biokimia); dan (c) pelepasan fosfat selama degradasi substrat (mineralisasi fosfat biologis). Solubilisasi Kalium. PGPR mampu melarutkan batu kalium melalui produksi dan sekresi asam organik. Produksi Siderophore. Siderophores telah terlibat baik untuk peningkatan langsung dan tidak langsung dari pertumbuhan tanaman oleh PGPR. Produksi fitohormon. PGPR mampu menghasilkan fitohormon, diantaranya indole acetic acid (IAA), sitokinin, giberelin, dan etilen. Selain perannya dalam memasok nutrisi bagi tanaman, PGPR juga berperan sebagai bioprotektan, yaitu agen pengendali hama dan penyakit dengan cara menghasilkan antibiotik dan menginduksi tanaman untuk memproduksi senyawa ketahanan dalam jumlah yang cukup untuk menjaga kesehatan tanaman.