Para petani jagung hendaknya mengetahui beberapa gangguan pada tanaman jagung yang perlu diwaspadai, diantaranya hama cambuk, ulat daun dan ulat tanah, karat daun bercak daun, bulai dan lain-lainnya. a. Hama cabuk dapat menyerang tanaman jagung pada daun atau bunga berupa embun jelaga yang disebabkan oleh hama aphida. Dapat dikendalikan dengan insektula berbahan aktif piridaben. b. Ulat daun yang dapat menyerang pada tanaman jagung muda dan bisa fase pertumbuhan. Pengendaliannya dapat dilakukan dengan memberikan insektisida bahan aktif non sulpat atau super mentrin. c. Ulat tanah dapat menyerang bagian tanah dasar tanaman menyerang seharian. Ulat agrotis meletakkan telornya dibagian bawah permukaan daun atas sekeliling permukaan tanah bagian pertanaman. d. Karat daun terdapat bintik-bintik kecil berwarna coklat keemasan seperti karat pada daun jagung menyebabkan panas fotosintesis jagung tidak sempurna. Dapat dikendalikan dengan pestisida bahan aktif mankozeb atau propineb. e. Bercak daun yakni daun yang terserang terdapat plak-plak kecil dan daun menjadi putih dan kering yang menyebabkan proses fotosintesis jagung tidak sempurna. Dapat dikendalikan dengan pestisida dengan bahan aktifnya motosil atau propint. Untuk mengendalikan pada tanaman jagung dapat dilakukan dengan pra tumbuh dan setelah tumbuh dialkukan dengan cara mekanik (mencangkuli) atau mencabuti tanaman gulma. Juga dapat dilaksanakan dengan pemberian herbisida (gromopone) setelah tanaman jagung bersama 14 Hg dengan menggunakan herbisida selektif pada tanaman jagung. Sedangkan bulai terjadi pada waktu tanaman masih muda, yakni 2,5 minggu setelah tanaman jagung pada areal panas kering dan lembab. Hal ini berakibat tanaman tumbuh dengan tidak normal misalnya (diantara tongkol daun dan batangnya). Terjadinya serangan hebat akibat tanaman tidak panen.penyakit bulai ditandai dengan bagian daun berwarna hijau kekuningan dan kecil. Pada permukaan bawah yang terserang terdapat spora jamur. Penyakit ini dapat dicegah dengan seedtreadment bahan aktif metalaksil serta membuang dan mengubur tanaman yang diserang (Darman-Tarusan)