Pelaksanaan panen padi gogo adalah sama dengan panen padi sawah. Panen padi gogo varietas unggul baru (VUB padi gogo) dilakukan dengan arit di pangkal batang dan merontoknya dengan giles atau gebot. Hasil panen dijemur dan setelah kering disimpan dalam karung. Pelaksanaan panen padi gogo lokal biasanya dengan ani-ani dengan memotong tangkai malai. Tangkai malai diikat dari 2 kepalan atau lebih dan dijemur. Sesudah kering malai dalam tangkai dengan teknik tertentu disatukan sebanyak 2 kepalan atau lebih dan diikat menjadi satu pocong. Padi dalam bentuk pocong, sebanyak 2 pocong disatukan atau diikat dengan teknik tertentu menjadi satu gedeng (sepasang pocong). Padi dalam bentuk gedeng untuk selanjutnya disimpan di lumbung. (Sumber: Pedoman SLPTT Padi Gogo BBPT Padi)