Pemangkasan merupakan kegiatan mengurangi atau membuang cabang, ranting tanaman kakao yang tidak produktif lagi dan juga cabang yang terserang hama dan penyakit. Tujuan utama dari pemangkasan adalah untuk membentuk kerangka percabangan kakao yang seimbang. Dengan pemangkaan sebenarnya merangsang keluarnya bunga pada tanaman kakao.Cabang –cabang yang harus dipangkas pada tanaman kakao adalah : cabang sakit, cabang terserang hama, cabang balik, cabang cambuk, cabang tumpang tindih, cabang cacing, cabang gantung, cabang/ranting kering. Adanya tindakan pemangkasan ternyata mampu merangsang berbagai organ baru khususnya cabang, daun-daunnan baru yang lebih produktif dan meningkatkan tanaman untuk berproduktif. Pemangkasan pada tanaman kakao ada 3 jenis yaitu : 1. pemangkasan bentuk pada tanaman berumur 18-24 bulan, Pemangkasan dasar dengan memotong cabang-cabang 60 cm dari jorget ,yang merunduk kebawah, berputar kedalam,tegak lurus 2. Pemangkasan pemeliharaan untuk semua usia tanaman dan dilakukan 1-2 bulan sekali, dan 3. Pemangkasan produksi yang dilakukan setelah panen raya.