Selain air, paling sedikit ada 12 macam unsur esensial yang dibutuhkan tanaman jeruk diambil dari dalam tanah. Pertama unsur hara yang dibutuhkan dalam jumlah banyak (makro primer), meliputi nitrogen (N), fosfor (P), dan kalium (K). Kedua, unsur hara yang dibutuhkan dalam jumlah banyak hanya pada kondisi tertentu (makro sekunder), meliputi kalsium (Ca), magnesium (Mg) dan belerang (S). Ketiga, unsur hara yang dibutuhkan dalam jumlah sedikit tetapi bila kekurangan akan mempengaruhi produksi dan kelangsungan hidup tanaman (mikro), meliputi besi (Fe), seng (Zn) dan molibdenum (Mo). Kebutuhan unsur mikro biasanya bisa terpenuhi jika tanah diberi pupuk kandang secara teratur. Unsur mikro juga banyak dijual sebagai pupuk daun, contohnya : "MICROCIT" yaitu pupuk mikro lengkap yang diformulasikan khusus untuk tanaman jeruk.. Dosis pupuk yang dibutuhkan oleh tanaman dipengaruhi oleh jenis/varietas, umur, hasil atau biomasa yang dihasilkan tanaman, dan faktor lingkungan. Ada beberapa pendekatan untuk menentukan dosis pupuk, yaitu analisis tanah atau daun, percobaan lapangan pada berbagai umur tanaman, pergantian hara yang hilang untuk pertumbuhan dan hasil panen, dan gejala kasat mata. Bagi petani yang jauh dari laboratorium Ilmu Tanah dan lahannya sempit serta terpencar, pendekatan paling mudah dan hasil panen dikombinasi dengan analisis tanah. Rekomendasi berdasarkan umur tanaman digunakan terutama pada periode tanaman belum menghasilkan (TBM). Awalnya tanaman perlu dipupuk N lebih banyak agar pertumbuhan vegetatifnya optimal. Saat berumur tiga tahun , tanaman mulai memasuki transisi menuju periode menghasilkan buah/dewasa (TM), sehingga porsi P dan K ditingkatkan guna mendukung pembentukan organ generatifnya. Walaupun tanaman membutuhkan dosis pupuk lebih rendah, aplikasinya harus lebih sering karena jangkauan akar untuk menyerap pupuk masih sempit/terbatas. Pada umur tanaman 4 tahun keatas, pupuk diaplikasikan dua kali setahun yaitu setelah panen dan 4 bulan setelah pemupukan pertama.