Pemupukan merupakan proses untuk memperbaiki atau memberikan tambahan unsure-unsur hara pada tanah, baik secara langsung atau tidak langsung agar dapat memenuhi kebutuhan bahan makanan pada tanaman. Tujuan dilakukan pemupukan antara lain untuk meningkatkan kesuburan tanah, memberikan nutrisi untuk tanaman dan memperbaiki kualitas sertan kuantitas tanaman Dosis pupuk pada tanaman kedelai yang digunakan sangat tergantung pada jenis lahan dan kondisi tanah. Pada tanah subur atau tanah bekas ditanami padi dengan dosis pupuk tinggi, pemupukan tidak diperlukan. Pada tanah yang kurang subur, pemupukan dapat menaikkan hasil. Tanaman dipupuk dengan 50kg Urea, 75 kg SP-36 dan 100-150 kg KCl per hektar pada saat tanam atau sekitar 175-200 kg/ha NPK. Pada lahan sawah yang subur atau lahan sawah bekas tanaman padi yang dipupuk dengan dosis tinggi tanaman tidak perlu tambahan pupuk NPK.