Pengendalian OPT dilakukan dengan cara Pengendalian Hama Terpadu (PHT). Adapun Prinsip-prinsip PHT adalah sebagai berikut : Budidaya tanaman sehat salah satunya adalah dengan melaksanakan Panca Usaha Tani Pelestarian musuh alami salah satunya dengan mengurangi pemakaian insektisida yang berlebihan. Pengamatan intensif, dimana petani diharapkan mengamati tanaman jagungnya minimal satu kali dalam Petani ahli PHT, dengan adanya pengamatan oleh petani diharapkan petani akan ahli dalam menangani hama dan penyakit tanaman Pengendalian OPT pada tanaman jagung dapat dilakukan dari mulai pelaksanan pengolahan tanah, pemilihan varietas benih, penanaman, pemupukan, penggunanan insektisida serta fungisida yang tapat wktu serta tepat sasaran. Untuk pengendalian OPT dapat dilakukan dengan kulturteknis (waktu dan pola tanam, pengolahan lahan intensif, pemilihan varitas tahan penyakit). Pengendalian dengan cara hayati (pemanfaatan musuh alami predator/parasitoid/pathogen). Pengendalian secara Fisik dan Mekanik (Perlakuan suhu, mengumpulkan larva atau pupa kemudian dimusnahkan, penggunaan perangkap seksferomon, serta pemusnahan tanaman sakit).Pengendalian secara kimia (penggunaan pestisida, insektisi dan untuk saranggga, fungisida untuk cendawan, bakterisida untuk bakteri dll). Pengendalian secara kimia merupakan alternative terakhir bila serangan telah melawati ambang batas ekonomi. Hama dan Penyakit yang banyak dijumpai pada tanaman jagung adalah penyakit bulai Pengendalian penyakit bulai dengan perlakuan benih, 1 kg benih dicampur dengan metalaksis (Ridhomil atau Saromil) 2 gr yang dilarutkan dalam 7,5-10 ml air. Sementara itu untuk jamur (Fusarium) dapat disemprot dengan Fungisida (Dithane M-45) dengan dosis 45 gr / tank isi 15 liter. Penyemprotan dilakukan pada bagian tanaman di bawah tongkol. Ini dilakukan sesaat setelah ada gejala infeksi jamur. Dapat juga dilakukan dengan cara membuang daun bagian bawah tongkol dengan ketentuan biji tongkol sudah terisi sempurna dan biji sudah keras. Hama lalat bibit, penggerek batang dan tongkol. Lalat bibit umumnya mengganggu pada saat awal pertumbuhan tanaman, oleh karena itu pengendaliannya dilakukan mulai saat tanam menggunakan insektisida carbofuran utamanya pada daerah-daerah endemik serangan lalat bibit. Untuk hama penggerek batang, jika mulai nampak ada gejala serangan dapat dilakukan dengan pemberian carbofuran (3-4 butir carbofuran/tanaman) melalui pucuk tanaman pada tanaman yang mulai terserang. Hama penggerek batang dikendalikan dengan memberikan insektisida caebofuran sebanyak 3-4 butir dengan ditugal bersamaan pemupukan atau disemprot dengan insektisida cair fastac atau regent dengan dosis sesuai yang tertera pada kemasan