Penyiangan padi gogo merupakan bagian yang sangat berat bagi petani padi gogo, hal ini disebabkan karena tumbuhnya benih gulma bersamaan dengan tumbuhnya benih padi gogo dan pertumbuhan gulma selanjutnya lebih cepat dari pertumbuhan padi gogo. Oleh karena itu pengendaiian gulma padi gogo dimulai pada beberapa hari setelah tanam benih. Pada lahan yang diolah sederhana dengan cangkul atau dengan bahan kimia yang dilakukan musim kering, maka pada saat waktu tanam di musim hujan pada 1 -2 hari sebelum tanam benih atau pada 1-2 hari setelah tanam benih, lahan diaplikasi dengan herbisida untuk menekan pertumbuhan gulma berdaun lebar maupun berdaun sempit. Penggunaan herbisida sebaiknya setelah biji gulma berdaun lebar atau berdaun sempit tumbuh/berkecambah. Pada lahan yang di olah dengan garpu di musim kering untuk membalik tanah maka biasanya gulma tidak tumbuh sampai 2 bulan setelah tanam, menyebabkan pertanaman padi gogo tidak perlu disiang, karena pada saat 2 bulan daun padi sudah menutup. Hal ini telah dilaksanakan oleh sebagian petani di Cianjur Selatan-Jawa Barat saat dilaksanakannya SL- PTT Padi Gogo. (Sumber: Pedoman SLPTT Padi Gogo BBPT Padi)