Bakteri Perakaran (Rhizobacteria) Bakteri yang memiliki peran penting dalam tanah salah satunya yaitu bakteri perakaran atau bisa disebut dengan Rhizobacteria yang menggambarkan bakteri rhizosfer yang membentuk koloni dengan akar. Kolonisasi akar merupakan suatu porses dimana bakteri melakukan inokulasi ke dalam benih tanaman atau ke dalam tanah, menempel pada permukaan akar, dan mengkoloni sistem perakaran yang sedang berkembang. Manfaat positif yang dihasilkan oleh bakteri rhizosfer telah memberikan sumber potensial bagi ketersediaan unsur hara atau nutrisi dalam tanah serta mendorong pertumbuhan tanaman. Beberapa bakteri juga memberika manfaat sebagai bioprotectan untuk menjadi agen anti patogen yang dapat menyerang tanaman. Bakteri tersebut dikelompokkan ke dalam bakteri PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria). PGPR (Plant Growth-Promoting Rhizobacteria) adalah bakteri pemacu pertumbuhan tanaman. Bakteri yang terdapat dalam PGPR adalah sejenis bakteri yang biasa hidup di akar tanaman. Mikroorganisme ini hidup berkoloni di sekitar akar tanaman yang dapat membantu memacu pertumbuhan tanaman dan meningkatkan ketahanan tanaman terhadap jamur patogen. Bagaimana bakteri PGPR dapat memacu pertumbuhan? Bakteri PGPR mampu mengikat nitrogen bebas dari alam atau istilahnya fikasi nitrogen bebas. Nitrogen bebas diubah menjadi amonia kemudian disalurkan ke tanaman. Bakteri akar ini juga mampu menyediakan beragam mineral yang dibutuhkan tanaman seperti besi, fosfor, atau belerang. PGPR juga memacu peningkatan hormon tanaman. Peningkatan hormon tanaman inilah yang secara langsung mempengaruhi pertumbuhan tanaman. Secara umum fungsi PGPR dalam meningkatkan pertumbuhan tanaman yaitu : (1) sebagai pemacu pertumbuhan (biostimulan) dengan mengatur konsentrasi berbagai zat pengatur tumbuh (fitohormon) seperti IAA, giberelin, sitokinin dan etilen di sekitar akar; (2) sebagai penyedia hara (bioferilizer) dengan menambat N2 dari udara dan melarutkan hara P yang terikat dalam tanah; (3) sebagai pengendali pathogen yang berasal dari tanah (bioprotectans) dengan cara menghasilkan senyawa anti pathogen seperti siderofor, kitinase, dan sianida. Kemudian lebih dispesifikasikan dengan perbedaan peran secara langsung dan tidak langsung. Bakteri PGPR berperan secara langsung dan tidak langsung, mekanisme secara langaung bakteri dapat menghasilkan fitohormon (IAA, giberelin, atau sitokinin), meningkatkan aktivitas enzim (protease, selulase, katalase), melarutkan mineral seperti fosfat. Untuk mekanisme secara tidak langsung, bakteri mampu mencegah pathogen dengan menghasilkan asam sianida (HCN) dan siderofor dan juga dapat dengan menghasilkan ACC Deaminase untuk pembentukan hormon.